Номер по Госреестру СИ: 47873-11
47873-11 Анализатор геномный
(GS FLX)
Назначение средства измерений:
:
Анализатор геномный GS FLX предназначен для высокопроизводительного определения нуклеотидных последовательностей ДНК методом пиросеквенирования, для проведения исследований в области нанобиотехнологий, молекулярной биологии и медицины.
Внешний вид.
Анализатор геномный
Рисунок № 1
Знак утверждения типа
Знак утверждения типаЗнак утверждения типа наносится на корпус нижнего блока сзади методом наклейки и на титульный лист паспорта методом печати.
Сведения о методиках измерений
Сведения о методиках (методах) измерений: отсутствуют
Нормативные и технические документы
Нормативные и технические документы, устанавливающие требования к анализатору геномному GS FLX:
1. Анализатор геномный GS FLX. руководство по эксплуатации
Поверка
Поверкаосуществляется по документу МП 47873-11 «Анализатор геномный GS FLX. Методика поверки», утвержденному ГЦИ СИ ФГУП «ВНИИМС» в 2011 году.
Основным средством поверки является: Стандартный образец фрагмента плазмиды pUC18 длиной 271 нуклеотид; концентрация ДНК в СО составляет 49,1 нг/мкл ±10,7%
Заявитель
Учреждение Российской академии наук Центр «Биоинженерия» РАН 117312, Москва, проспект 60-летия Октября, д.7, корп.1В основе работы анализатора геномного GS FLX лежит технология, базирующаяся на методе пиросеквенирования. Пиросеквенирование основано на определении пирофосфата, образующегося при синтезе ДНК. Во время работы анализатора геномного GS FLX нуклеотиды проходят последовательно в определенном порядке через миллион микроскопических лунок проточного планшета PicoTiterPlate™, в которых находятся частицы с иммобилизованными на них копиями одноцепочечных фрагментов ДНК из библиотеки фрагментов образца ДНК. При прохождении нуклеотидов происходит одновременное параллельное секвенирование уникальных одноцепочечных ДНК на каждой частице, в каждой лунке планшета. Если через лунку проходит нуклеотид, комплементарный матрице, полимераза удлиняет цепь, встраивая этот нуклеотид. Добавление нуклеотида приводит к высвобождению пирофосфата и далее к реакции, в результате которой генерируется световой сигнал, регистрируемый CCD-камерой прибора. Интенсивность сигнала пропорциональна количеству нуклеотидов, встроенных в цепь ДНК во время одного прохода нуклеотидов.
Рисунок 1. Общий вид анализатора геномного GS FLX.
Анализатор геномный GS FLX состоит из следующих блоков: Анализатор геномный GS FLX (базовый блок)
Управляющий компьютер с операционной системой Linux
Пакет программ (Genome Sequencer FLX Instrument Software), включающий программы GS Sequencer и GS Run Processor.
Устройство для нанесения частиц на пикотитровальную пластину (Bead Deposition Device, для пластины размером 70х75 мм, 2 больших региона)
Устройство для нанесения частиц на пикотитровальную пластину (Bead Deposition Device, для пластины размером 70х75 мм, 4 средних региона)
Устройство для нанесения частиц на пикотитровальную пластину (Bead Deposition Device, для пластины размером 70х75 мм, 8 средних/малых регионов)
Устройство для нанесения частиц на пикотитровальную пластину (Bead Deposition Device, для пластины размером 70х75 мм, 16 малых регионов)
Противовес устройств для нанесения частиц на пикотитровальную пластину (Counterweight for Bead Deposition Devices)
Контейнер для реактивов (GS FLX Reagents Cassette)
Защиты лицевой панели камеры (Camera Faceplate Guard)
Держатель промывочных пробирок (Pre-wash Tube Holder) Комплект соединительных кабелей
В состав анализатора геномного GS FLX входит специализированное программное обеспечение, идентификационные данные которого приведены ниже.
Наименование программного обеспечения |
Идентификационное наименование про граммного обеспечения |
№вер сии ПО |
Цифровой идентификатор про граммного обеспечения (контрольная сумма) |
Алгоритм вычисления идентификатора ПО |
Genome Sequencer FLX Instrument Software, включающий программы GS Sequencer и GS Run Processor. |
ipcManager dataManager imageProcManager instrumentManagerAM runDataMatrix imageWrite gsRunBrowser getCalibrationTable sendCalibrationTable flashCalibrationTable gsRUnProcessor |
2.6 |
a53346dcb489f1e7db3b3c15e403e40e 5aba7f243401be02a2a085fc59a70b8a 7a88587fbba96e4d8e7386b1ef7aee68 9ad3f4f968332ac6289de539c5435293 f0528e6e9525fefe013a0d29e222bf0a f0528e6e9525fefe013a0d29e222bf0a cfac81694304edbc82591a1278ac3fa3 3e98aa7bbddc67428a198c1e87d5dd57 cafb9e3b5644db342470ac05af3d26c6 cafb9e3b5644db342470ac05af3d26c6 18b1 ec4fbdc82efe23 aedc4377eabff7 |
Программа md5sum |
Уровень защиты программного обеспечения от непреднамеренных и преднамеренных изменений в соответствии с МИ 3286-2010 соответствует уровню «С». Блок управления анализатора геномного защищен от несанкционированного доступа за счет опломбирования крышек их корпусов.
Анализатор геномный GS FLX (базовый блок) |
1 шт |
Управляющий компьютер с операционной системой Linux |
1 шт |
Пакет программ (Genome Sequencer FLX Instrument Software), включающий программы GS Sequencer и GS Run Processor. |
1 шт |
Устройство для нанесения частиц на пикотитровальную пластину (Bead Deposition Device) и противовес |
1 шт |
Устройство для нанесения частиц на пикотитровальную пластину (Bead Deposition Device, для пластины размером 70х75 мм, 2 больших региона) |
1 шт |
Устройство для нанесения частиц на пикотитровальную пластину (Bead Deposition Device, для пластины размером 70х75 мм, 4 средних региона) |
1 шт |
Устройство для нанесения частиц на пикотитровальную пластину (Bead Deposition Device, для пластины размером 70х75 мм, 8 средних/малых регионов) |
1 шт |
Устройство для нанесения частиц на пикотитровальную пластину (Bead Deposition Device, для пластины размером 70х75 мм, 16 малых регионов) |
1 шт |
Противовес устройств для нанесения частиц на пикотитровальную пластину (Counterweight for Bead Deposition Devices) |
1 шт |
Контейнер для реактивов (GS FLX Reagents Cassette) |
2 шт |
Защита лицевой панели камеры (Camera Faceplate Guard) |
1 шт |
Держатель промывочных пробирок (Pre-wash Tube Holder) |
1 шт |
Руководство по эксплуатации |
1 экз |
Методика поверки |
1 экз |
Наименование |
Значение |
Точность определения нуклеотидной последовательности |
Кол-во чтений стандартного образца, не содержащих ошибок: >75% Кол-во чтений стандартного образца, содержащих 1 ошибку: <15% Кол-во чтений стандартного образца, содержащих 2 ошибки: <10% Кол-во чтений стандартного образца, содержащий 3 и более ошибок: <5% Доля ошибочно прочтенных нуклеотидов при чтении стандартного образца: не более 2% |
Точность определения нуклеотидной последовательности участка ДНК, представляющего собой повтор из более, чем двух одинаковых нуклеотидов |
Средняя доля прочтений участка из трех одинаковых нуклеотидов подряд, в которых он прочтен без ошибок: > 93%, Средняя доля прочтений участка из четырех одинаковых нуклеотидов подряд, в которых он прочтен без ошибок: > 85%, Средняя доля прочтений участка из пяти одинаковых нуклеотидов подряд, в которых он прочтен без ошибок: > 75%. |
Длина прочтения индивидуальной реакции |
>50% чтений индивидуальных реакций имеют длину более 350 нуклеотидов |
Производительность (общая длина прочтенных нуклеотидных последовательностей), за один рабочий цикл |
350-500 млн. нуклеотидов |
Среднее число независимых чтений за один рабочий цикл |
~1 млн. чтений в микролунках планшета PicoTiterPlate™ Titanuim |
Время работы (один рабочий цикл) |
10 часов |
Размеры верхнего блока (ширина x длина x высота), мм |
743х698х361 |
Размеры нижнего блока (ширина x длина x высота), мм |
752х908х927 |
Источники питания |
230В±14% 50/60 Гц 1250 ВА |
Рабочие условия:
температура окружающего воздуха 15-30оС;
Влажность 20-80%;